15 년 전에 태평양의 황량한 곳에서 유람선이 빙산과 충돌하여 바다에서 길을 잃었다10 여 년 후, 선박 엔지니어 인 야시로 히데토 (Hideto Yashiro) 는 치명적인 자동차 사고로 사망했습니다. 이 사건들 사이의 가능성이없는 연결은 고급 라이너 St. 에서만 밝혀집니다.처녀 항해 중 아프로디테. 코고로 모리, 그의 딸 란, 코난 에도가와, 소년 탐정은 스즈키 소노코의 가족이 제공하는 여행을 즐깁니다.그러나 숨바꼭질이 소노코의 실종으로 이어지면서 그들의 재미는 곧 짧아진다. 얼마 후, 세인트 (St.) 를 건설 한 야시로 (Yashiro) 그룹의 CEO아프로디테는 칼에 찔려 죽은채 발견되었고 그녀의 아버지는 실종되었다. 경찰의 수사가 막다른 골목으로 치닫는 동안, 코난은 범인에게 포문을 닫는다.체포되기를 꺼리는 범인은 성 아프로디테를 날려 버리고 모든 승객을 가라 앉히겠다고 위협합니다.배의 선체가 빠르게 물로 채워짐에 따라 복수심에 불타는 살인 사건의 진실이 마침내 드러납니다.탈출 할 곳이 없기 때문에, 코난과 코고로는 선상에있는 모든 사람들이 해저로 끌려 가기 전에 애매한 범인과 씨름해야합니다.