Fifteen tahun yang lalu di Baring Pasifik, kapal pesiar setara dengan iceberg dan hilang di laut.Lebih dari satu dekade kemudian, hireto Yashiro-a ship engineer-meninggal dalam kecelakaan mobil yang fatal. Koneksi yang tidak mungkin antara acara-acara ini hanya datang cahaya pada kapal mewah St.Aphrodite selama Ekspedisi. Di atasnya pada waktu liburan yang jauh diperlukan, Kogorou Mouri, anak perempuanya berlari, Conan Edogawa, dan detektif anak laki-laki menikmati perjalanan yang disediakan oleh keluarga Suzuki Sonoko.Tapi keseruan mereka segera dipotong singkat ketika permainan bongkar pasang dan tersembunyi menyebabkan hilangnya Sonoko. Beberapa waktu kemudian, direktur eksekutif Mishi group, yang membangun St.Aphrodite, ditemukan tertusuk mati dan ayah nya hilang. Saat investigasi polisi berubah kematian, Conan ditutup jahatTidak bersedia menyenangkan, prosesnya meyakinkan untuk membuang St. Aphrodite dan tenggelam semua penumpang.Karena kulit kapal cepat mengisi air, kebenaran di balik pembunuhan dendam akhirnya muncul.Tanpa tempat untuk keluar, Conan dan Kogorou harus bergulat dengan hasil eksklusif sebelum semua orang di papan tersambung ke lantai laut.